Terdapat beberapa teknik pelaksanaan dalam melakukan audit operasional, yaitu:
- Observasi. Secara langsung meninjau objek yang diteliti dengan tujuan untuk memperoleh pemahaman dan gambaran yang memadai serta mengidentifikasi hal-hal yang periu diperhatikan atau yang tidak memenuhi syarat.
- Wawancara. Secara langsung melakukan tanya jawab dengan personel yang terkait berdasarkan daftar pertanyaan yang telah dibuat, dengan tujuan untuk mendapatkan informasi mengenai objek yang diteliti.
- Analisis. Tinjuan terhadap data-data yang ada dan berhubungan dengan objek yang diteliti sehingga unsur-unsur yang penting dapat diketahui.
- Verifikasi. Pembuktian untuk mengukuhkan apa yang tertulis dengan mengaitkan pada fakta yang diperoleh dari pembuktian kebenaran suatu pernyataan.
- Penyelidikan. Usaha lanjutan dalam melakukan verifikasi terhadap suatu penyimpangan untuk menjabarkan adanya permasalahan.
- Evaluasi. Agar dapat menarik kesimpulan tentang bidang yang diaudit berdasarkan informasi yang diperoleh dibutuhkan suatu penilaian secara keseluruhan.